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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148611
Cell Name :  R1_PFC_S10_C3
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  34.0 days
Max Age :  34.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  165 grams
Max Weight :  165 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R1_PFC_S10_C3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  635.9 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  33
Number of Branches :  72
Overall Width :  182.12 μm
Overall Height :  429.36 μm
Overall Depth :  101.86 μm
Average Diameter :  0.19 μm
Total Length :  3619.36 μm
Total Surface :  2160.41 μm2
Total Volume :  102.62 μm3
Max Euclidean Distance :  281.28 μm
Max Path Distance :  312.46 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1103
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  74.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.56°
Fractal Dimension :  1.03

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