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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148581
Cell Name :  R12_PFC_S3_C2
Archive Name :  Hof_Varghese
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  130 grams
Max Weight :  130 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-12-17
Date of Upload :  2021-01-14
Persistence Vector :  R12_PFC_S3_C2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Altered synaptic ultrastructure in the prefrontal cortex of Shank3-deficient rats.

Measurements
Soma Surface :  580.26 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  26
Overall Width :  179.49 μm
Overall Height :  183.4 μm
Overall Depth :  71.83 μm
Average Diameter :  0.19 μm
Total Length :  1351.55 μm
Total Surface :  806.74 μm2
Total Volume :  38.32 μm3
Max Euclidean Distance :  150.07 μm
Max Path Distance :  158.72 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  475
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  74.14°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.55°
Fractal Dimension :  1.03

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