8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_110626
Cell Name :  Parmhans2018_Figure_6_a2
Archive Name :  Badea
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl6/129Sv
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Ret-positive, ON type, Alpha
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  flattened
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Reported 25%
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2019-02-14
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Parmhans2018_Figure_6_a2.pvec
Note :  Genotype: RetCreERT2/WT; Rosa26AP/WT

Reference Article
Related Article Reference :  Characterization of retinal ganglion cell, horizontal cell, and amacrine cell types expressing the neurotrophic receptor tyrosine kinase Ret.

Measurements
Soma Surface :  411.48 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  48
Number of Branches :  100
Overall Width :  138.66 μm
Overall Height :  224.17 μm
Overall Depth :  50 μm
Average Diameter :  1.28 μm
Total Length :  3579.27 μm
Total Surface :  14899.5 μm2
Total Volume :  5631.6 μm3
Max Euclidean Distance :  147.38 μm
Max Path Distance :  223.35 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  1909
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  72.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.62°
Fractal Dimension :  1.09

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