8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_147370
Cell Name :  PVN9_microglia_37
Archive Name :  Althammer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  280 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  Paraventricular hypothalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-08-20
Date of Upload :  2021-01-13
Persistence Vector :  PVN9_microglia_37.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis reveals time-dependent structural changes in microglia and astrocytes in the central amygdala and hypothalamic paraventricular nucleus of heart failure rats.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  63
Number of Branches :  128
Overall Width :  16.31 μm
Overall Height :  44.86 μm
Overall Depth :  31.93 μm
Average Diameter :  1.09 μm
Total Length :  451.45 μm
Total Surface :  1577.08 μm2
Total Volume :  820.06 μm3
Max Euclidean Distance :  38.96 μm
Max Path Distance :  47.92 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1125
Partition Asymmetry :  0.71
Average Rall's Ratio :  1.61
Average Bifurcation Angle Local :  43.21°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.87°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website