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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148153
Cell Name :  PVN9_microglia_34
Archive Name :  Althammer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  280 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  Paraventricular hypothalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-08-20
Date of Upload :  2021-01-13
Persistence Vector :  PVN9_microglia_34.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis reveals time-dependent structural changes in microglia and astrocytes in the central amygdala and hypothalamic paraventricular nucleus of heart failure rats.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  226
Number of Branches :  453
Overall Width :  31.63 μm
Overall Height :  44 μm
Overall Depth :  37.4 μm
Average Diameter :  0.84 μm
Total Length :  1350.01 μm
Total Surface :  3513.84 μm2
Total Volume :  1380.06 μm3
Max Euclidean Distance :  31.12 μm
Max Path Distance :  42.57 μm
Max Branch Order :  30
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  3455
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  1.69
Average Bifurcation Angle Local :  48.12°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.25°
Fractal Dimension :  1.04

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