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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_147195
Cell Name :  PVN9_microglia_33
Archive Name :  Althammer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  280 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  Paraventricular hypothalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-08-20
Date of Upload :  2021-01-13
Persistence Vector :  PVN9_microglia_33.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis reveals time-dependent structural changes in microglia and astrocytes in the central amygdala and hypothalamic paraventricular nucleus of heart failure rats.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  78
Number of Branches :  157
Overall Width :  19.95 μm
Overall Height :  43.5 μm
Overall Depth :  32.58 μm
Average Diameter :  1.03 μm
Total Length :  520.86 μm
Total Surface :  1767.79 μm2
Total Volume :  920.82 μm3
Max Euclidean Distance :  38.57 μm
Max Path Distance :  55.48 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1300
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.64
Average Bifurcation Angle Local :  46.18°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.18°
Fractal Dimension :  1.04

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