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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_147223
Cell Name :  PVN5_microglia_19
Archive Name :  Althammer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  280 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  Paraventricular hypothalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-08-20
Date of Upload :  2021-01-13
Persistence Vector :  PVN5_microglia_19.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis reveals time-dependent structural changes in microglia and astrocytes in the central amygdala and hypothalamic paraventricular nucleus of heart failure rats.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  42
Number of Branches :  86
Overall Width :  11.74 μm
Overall Height :  38.66 μm
Overall Depth :  30.9 μm
Average Diameter :  1.51 μm
Total Length :  357.85 μm
Total Surface :  1725.67 μm2
Total Volume :  1121.17 μm3
Max Euclidean Distance :  30.08 μm
Max Path Distance :  38.09 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  889
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  1.59
Average Bifurcation Angle Local :  48.99°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.64°
Fractal Dimension :  1.05

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