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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_148082
Cell Name :  PVN27_microglia40
Archive Name :  Althammer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  280 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  Paraventricular hypothalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-08-20
Date of Upload :  2021-01-13
Persistence Vector :  PVN27_microglia40.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis reveals time-dependent structural changes in microglia and astrocytes in the central amygdala and hypothalamic paraventricular nucleus of heart failure rats.

Measurements
Soma Surface :  153 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  132
Number of Branches :  270
Overall Width :  32.85 μm
Overall Height :  53.68 μm
Overall Depth :  36.8 μm
Average Diameter :  1.34 μm
Total Length :  1027.87 μm
Total Surface :  4403.12 μm2
Total Volume :  2670.81 μm3
Max Euclidean Distance :  33.8 μm
Max Path Distance :  56.56 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  2534
Partition Asymmetry :  0.69
Average Rall's Ratio :  1.6
Average Bifurcation Angle Local :  43.17°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.96°
Fractal Dimension :  1.04

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