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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_147179
Cell Name :  PVN18_microglia12
Archive Name :  Althammer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  280 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  Paraventricular hypothalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-08-20
Date of Upload :  2021-01-13
Persistence Vector :  PVN18_microglia12.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis reveals time-dependent structural changes in microglia and astrocytes in the central amygdala and hypothalamic paraventricular nucleus of heart failure rats.

Measurements
Soma Surface :  152.49 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  128
Number of Branches :  257
Overall Width :  36.96 μm
Overall Height :  56.24 μm
Overall Depth :  47.93 μm
Average Diameter :  1.03 μm
Total Length :  1073.11 μm
Total Surface :  3431.21 μm2
Total Volume :  1620.64 μm3
Max Euclidean Distance :  41.66 μm
Max Path Distance :  74.64 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  2821
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  1.71
Average Bifurcation Angle Local :  47.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.99°
Fractal Dimension :  1.04

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