8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_147747
Cell Name :  PVN13_microglia_26
Archive Name :  Althammer
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  250 grams
Max Weight :  280 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  Paraventricular hypothalamic nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-08-20
Date of Upload :  2021-01-13
Persistence Vector :  PVN13_microglia_26.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Three-dimensional morphometric analysis reveals time-dependent structural changes in microglia and astrocytes in the central amygdala and hypothalamic paraventricular nucleus of heart failure rats.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  77
Number of Branches :  155
Overall Width :  14.85 μm
Overall Height :  20.22 μm
Overall Depth :  45.23 μm
Average Diameter :  1.06 μm
Total Length :  525.8 μm
Total Surface :  1827.73 μm2
Total Volume :  1021.68 μm3
Max Euclidean Distance :  40.49 μm
Max Path Distance :  83.33 μm
Max Branch Order :  28
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1254
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  41.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.38°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website