8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36587
Cell Name :  PVIN-T2-20130306-01
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  CB6-Tg(Gad1-EGFP)G42Zjh/J [GAD67-GFP (line G42)]
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive
Tertiary Cell Class :  Type 2
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Not reported
Staining Method :  Green fluorescent protein (GFP), Alexa Fluor 594 hydrazide
Slicing Direction :  near-coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2014-11-26
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  PVIN-T2-20130306-01.pvec
Note :  0

Reference Article
Related Article Reference :  Neuronal morphometry directly from bitmap images.

Measurements
Soma Surface :  6918.32 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  104
Number of Branches :  217
Overall Width :  488.42 μm
Overall Height :  752.88 μm
Overall Depth :  67 μm
Average Diameter :  3.41 μm
Total Length :  13453.9 μm
Total Surface :  168601 μm2
Total Volume :  205956 μm3
Max Euclidean Distance :  491.03 μm
Max Path Distance :  1016.31 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1979
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2.5
Average Bifurcation Angle Local :  75.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.13°
Fractal Dimension :  1.02

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