8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36584
Cell Name :  PVIN-T2-20130208-03
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  CB6-Tg(Gad1-EGFP)G42Zjh/J [GAD67-GFP (line G42)]
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive
Tertiary Cell Class :  Type 2
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Not reported
Staining Method :  Green fluorescent protein (GFP), Alexa Fluor 594 hydrazide
Slicing Direction :  near-coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2014-11-26
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  PVIN-T2-20130208-03.pvec
Note :  0

Reference Article
Related Article Reference :  Neuronal morphometry directly from bitmap images.

Measurements
Soma Surface :  15430.3 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  97
Number of Branches :  203
Overall Width :  634.4 μm
Overall Height :  708.19 μm
Overall Depth :  77.44 μm
Average Diameter :  3.77 μm
Total Length :  12018.9 μm
Total Surface :  152663 μm2
Total Volume :  186458 μm3
Max Euclidean Distance :  464.97 μm
Max Path Distance :  1021.63 μm
Max Branch Order :  26
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1717
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  2.19
Average Bifurcation Angle Local :  89.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.37°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website