8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36582
Cell Name :  PVIN-T2-20130207-02
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  CB6-Tg(Gad1-EGFP)G42Zjh/J [GAD67-GFP (line G42)]
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive
Tertiary Cell Class :  Type 2
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Not reported
Staining Method :  Green fluorescent protein (GFP), Alexa Fluor 594 hydrazide
Slicing Direction :  near-coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2014-11-26
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  PVIN-T2-20130207-02.pvec
Note :  0

Reference Article
Related Article Reference :  Neuronal morphometry directly from bitmap images.

Measurements
Soma Surface :  4794.6 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  127
Number of Branches :  262
Overall Width :  635.81 μm
Overall Height :  781.66 μm
Overall Depth :  85.36 μm
Average Diameter :  1.85 μm
Total Length :  19144.6 μm
Total Surface :  114756 μm2
Total Volume :  64683.2 μm3
Max Euclidean Distance :  627.06 μm
Max Path Distance :  1128 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  2018
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  2.53
Average Bifurcation Angle Local :  79.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.13°
Fractal Dimension :  1.02

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