8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_146140
Cell Name :  PTM_170727_01
Archive Name :  Roberts
Species Name :  mouse
Strain :  Vip-IRES-Cre/wt;Ai14(RCL-tdT)/wt
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  70.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  inferior colliculus, cortex
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  glutamatergic, Vasoactive Intestinal Peptide (VIP) expressing, auditory thalamus projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-11-16
Date of Upload :  2020-12-17
Persistence Vector :  PTM_170727_01.pvec
Note :  The anatomical location comprises dorsal and lateral cortices combined

Reference Article
Related Article Reference :  A novel class of inferior colliculus principal neurons labeled in vasoactive intestinal peptide-Cre mice.

Measurements
Soma Surface :  434.47 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  53
Overall Width :  173.18 μm
Overall Height :  192.73 μm
Overall Depth :  53.08 μm
Average Diameter :  1.06 μm
Total Length :  1921.63 μm
Total Surface :  6505.86 μm2
Total Volume :  2033.86 μm3
Max Euclidean Distance :  183.24 μm
Max Path Distance :  215.86 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1328
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  1.67
Average Bifurcation Angle Local :  75.99°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.39°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website