8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_146110
Cell Name :  PTM_161018_01
Archive Name :  Roberts
Species Name :  mouse
Strain :  Vip-IRES-Cre/wt;Ai14(RCL-tdT)/wt
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  70.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  inferior colliculus, central nucleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  glutamatergic, Vasoactive Intestinal Peptide (VIP) expressing, auditory thalamus projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-11-16
Date of Upload :  2020-12-17
Persistence Vector :  PTM_161018_01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A novel class of inferior colliculus principal neurons labeled in vasoactive intestinal peptide-Cre mice.

Measurements
Soma Surface :  213 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  29
Overall Width :  145.28 μm
Overall Height :  272.13 μm
Overall Depth :  58.49 μm
Average Diameter :  0.89 μm
Total Length :  1330.78 μm
Total Surface :  3807.95 μm2
Total Volume :  996.13 μm3
Max Euclidean Distance :  223.23 μm
Max Path Distance :  275.56 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  930
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  2.25
Average Bifurcation Angle Local :  44.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.99°
Fractal Dimension :  1.07

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