8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_146153
Cell Name :  PTM_160927_01
Archive Name :  Roberts
Species Name :  mouse
Strain :  Vip-IRES-Cre/wt;Ai14(RCL-tdT)/wt
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  70.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  inferior colliculus, central nucleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  glutamatergic, Vasoactive Intestinal Peptide (VIP) expressing, auditory thalamus projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-11-16
Date of Upload :  2020-12-17
Persistence Vector :  PTM_160927_01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A novel class of inferior colliculus principal neurons labeled in vasoactive intestinal peptide-Cre mice.

Measurements
Soma Surface :  282.72 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  43
Overall Width :  171.94 μm
Overall Height :  331.49 μm
Overall Depth :  28.91 μm
Average Diameter :  1.01 μm
Total Length :  1996.46 μm
Total Surface :  6466.16 μm2
Total Volume :  2025.81 μm3
Max Euclidean Distance :  295.05 μm
Max Path Distance :  430.07 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  1430
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2.16
Average Bifurcation Angle Local :  83.85°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.93°
Fractal Dimension :  1.05

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