8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_65070
Cell Name :  POM40c1
Archive Name :  Groh
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  somatosensory thalamus
Tertiary Brain Region :  posterior thalamic nucleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  thalamocortical
Tertiary Cell Class :  relay
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-08
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  POM40c1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Corticothalamic Spike Transfer via the L5B-POm Pathway in vivo.

Measurements
Soma Surface :  403.35 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  73
Number of Branches :  157
Overall Width :  199.02 μm
Overall Height :  273.19 μm
Overall Depth :  97.51 μm
Average Diameter :  0.67 μm
Total Length :  8092.28 μm
Total Surface :  17488.6 μm2
Total Volume :  3771.88 μm3
Max Euclidean Distance :  177.24 μm
Max Path Distance :  233.6 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  22012
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.55
Average Bifurcation Angle Local :  76.18°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.56°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website