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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_183871
Cell Name :  PI4KIIIa-3
Archive Name :  Liu
Species Name :  mouse
Strain :  ICR
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  PI4KIIIa +/- shRNA
Staining Method :  green fluorescent protein, Alexa Fluor 488, immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2022-05-06
Date of Upload :  2022-05-20
Persistence Vector :  PI4KIIIa-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Activity-dependent PI4P synthesis by PI4KIIIα regulates long-term synaptic potentiation.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  59
Number of Branches :  119
Overall Width :  110.83 μm
Overall Height :  337.28 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2160.84 μm
Total Surface :  1697.12 μm2
Total Volume :  106.07 μm3
Max Euclidean Distance :  310.1 μm
Max Path Distance :  384.39 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  5853
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  110.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  110.46°
Fractal Dimension :  1.04

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