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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_183885
Cell Name :  PI4KIIIa-2
Archive Name :  Liu
Species Name :  mouse
Strain :  ICR
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  PI4KIIIa +/- shRNA
Staining Method :  green fluorescent protein, Alexa Fluor 488, immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2022-05-06
Date of Upload :  2022-05-20
Persistence Vector :  PI4KIIIa-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Activity-dependent PI4P synthesis by PI4KIIIα regulates long-term synaptic potentiation.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  97
Number of Branches :  196
Overall Width :  134.2 μm
Overall Height :  327.81 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2820.03 μm
Total Surface :  2214.84 μm2
Total Volume :  138.43 μm3
Max Euclidean Distance :  305.76 μm
Max Path Distance :  590.61 μm
Max Branch Order :  39
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  7713
Partition Asymmetry :  0.76
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  101.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  109.67°
Fractal Dimension :  1.04

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