8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35790
Cell Name :  P7-TRAK2-MBD-4-001
Archive Name :  Kimura
Species Name :  mouse
Strain :  ICR
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  7.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in utero
Experimental Condition :  Mitochondrial Rho GTPase 1 (Miro1)-binding domain of trafficking kinesin protein 2 (TRAK2-MBD)
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-10-25
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  P7-TRAK2-MBD-4-001.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Evidence that dendritic mitochondria negatively regulate dendritic branching in pyramidal neurons in the neocortex.

Measurements
Soma Surface :  816.2 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  55
Number of Branches :  120
Overall Width :  94.52 μm
Overall Height :  146.94 μm
Overall Depth :  15.47 μm
Average Diameter :  0.11 μm
Total Length :  2058.2 μm
Total Surface :  711.04 μm2
Total Volume :  19.55 μm3
Max Euclidean Distance :  160.19 μm
Max Path Distance :  169.9 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  656
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2.07
Average Bifurcation Angle Local :  73.92°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.83°
Fractal Dimension :  1.02

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