8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35780
Cell Name :  P7-TRAK2-MBD-16-003
Archive Name :  Kimura
Species Name :  mouse
Strain :  ICR
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  7.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in utero
Experimental Condition :  Mitochondrial Rho GTPase 1 (Miro1)-binding domain of trafficking kinesin protein 2 (TRAK2-MBD)
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-10-25
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  P7-TRAK2-MBD-16-003.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Evidence that dendritic mitochondria negatively regulate dendritic branching in pyramidal neurons in the neocortex.

Measurements
Soma Surface :  817.59 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  54
Overall Width :  52.22 μm
Overall Height :  287.7 μm
Overall Depth :  10.69 μm
Average Diameter :  0.11 μm
Total Length :  879.49 μm
Total Surface :  303.13 μm2
Total Volume :  8.33 μm3
Max Euclidean Distance :  282.99 μm
Max Path Distance :  292.35 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  281
Partition Asymmetry :  0.75
Average Rall's Ratio :  2.21
Average Bifurcation Angle Local :  62.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.34°
Fractal Dimension :  1.02

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