8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_250069
Cell Name :  P15_n-1C_iontop-atP2_V62-V105_v1s31_Ch
Archive Name :  Gesuita_Karayannis
Species Name :  mouse
Strain :  SST-IRES-Cre(Ssttm2.1(cre)Zjh/J)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 1-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  80  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2022-10-09
Date of Upload :  2022-12-08
Persistence Vector :  P15_n-1C_iontop-atP2_V62-V105_v1s31_Ch.pvec
Note :  The axon consists of multiple traced single fragments rather than a single structure

Reference Article
Related Article Reference :  Microglia contribute to the postnatal development of cortical somatostatin-positive inhibitory cells and to whisker-evoked cortical activity.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  116
Number of Branches :  239
Overall Width :  245.38 μm
Overall Height :  269.09 μm
Overall Depth :  50 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  6237.3 μm
Total Surface :  4898.76 μm2
Total Volume :  306.17 μm3
Max Euclidean Distance :  220.39 μm
Max Path Distance :  419.48 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  11410
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  30.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.48°
Fractal Dimension :  1.06

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