8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_60194
Cell Name :  P06-normal-SPn-20090521-3-40X
Archive Name :  Lee_LJ
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  neonatal
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Subplate
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-25
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  P06-normal-SPn-20090521-3-40X.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Evidence for structural and functional changes of subplate neurons in developing rat barrel cortex.

Measurements
Soma Surface :  780.84 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  133
Number of Branches :  274
Overall Width :  178.65 μm
Overall Height :  281.79 μm
Overall Depth :  22 μm
Average Diameter :  0.3 μm
Total Length :  4849.24 μm
Total Surface :  4642.66 μm2
Total Volume :  566.25 μm3
Max Euclidean Distance :  221.06 μm
Max Path Distance :  242.68 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  2526
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.54
Average Bifurcation Angle Local :  69.67°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.15°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website