8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283406
Cell Name :  Olaf-Section-1_1-Reconstruction-3
Archive Name :  H_Zhang
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 InsG3680-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  association cortex, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2024-06-17
Date of Upload :  2024-07-10
Persistence Vector :  Olaf-Section-1_1-Reconstruction-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  SHANK3 Mutations Associated with Autism and Schizophrenia Lead to Shared and Distinct Changes in Dendritic Spine Dynamics in the Developing Mouse Brain.

Measurements
Soma Surface :  5048.51 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  48
Overall Width :  416.05 μm
Overall Height :  792.28 μm
Overall Depth :  97.76 μm
Average Diameter :  3.37 μm
Total Length :  4394.31 μm
Total Surface :  47675 μm2
Total Volume :  50954.9 μm3
Max Euclidean Distance :  727.41 μm
Max Path Distance :  739.13 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  306
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.36
Average Bifurcation Angle Local :  60.84°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.16°
Fractal Dimension :  1.01

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