8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283363
Cell Name :  Olaf-Section-1_1-Reconstruction-2
Archive Name :  H_Zhang
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 InsG3680-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  association cortex, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2024-06-17
Date of Upload :  2024-07-10
Persistence Vector :  Olaf-Section-1_1-Reconstruction-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  SHANK3 Mutations Associated with Autism and Schizophrenia Lead to Shared and Distinct Changes in Dendritic Spine Dynamics in the Developing Mouse Brain.

Measurements
Soma Surface :  5244.9 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  29
Number of Branches :  63
Overall Width :  409.9 μm
Overall Height :  800.73 μm
Overall Depth :  162.94 μm
Average Diameter :  3.27 μm
Total Length :  6021.84 μm
Total Surface :  63757 μm2
Total Volume :  67733.5 μm3
Max Euclidean Distance :  736.04 μm
Max Path Distance :  748.84 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  457
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.36
Average Bifurcation Angle Local :  71.66°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.18°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website