8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_101585
Cell Name :  Oct6IR3e-20x-NL-tgv
Archive Name :  Luebke
Species Name :  mouse
Strain :  CD1
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 4, primary somatosensory
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Tbr2 lineage
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, Streptavidin-Alexa 405
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-07-27
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  Oct6IR3e-20x-NL-tgv.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Distinct Neocortical Progenitor Lineages Fine-tune Neuronal Diversity in a Layer-specific Manner.

Measurements
Soma Surface :  973.33 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  46
Overall Width :  165.49 μm
Overall Height :  263.29 μm
Overall Depth :  35.1 μm
Average Diameter :  1.09 μm
Total Length :  2133.64 μm
Total Surface :  7537.6 μm2
Total Volume :  2580.71 μm3
Max Euclidean Distance :  191.73 μm
Max Path Distance :  240.03 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1220
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.76
Average Bifurcation Angle Local :  76.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.03°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website