8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_101598
Cell Name :  Oct5IR3h-20x-NL-tgv
Archive Name :  Luebke
Species Name :  mouse
Strain :  CD1
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 4, primary somatosensory
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Tbr2 lineage
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, Streptavidin-Alexa 405
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-07-27
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  Oct5IR3h-20x-NL-tgv.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Distinct Neocortical Progenitor Lineages Fine-tune Neuronal Diversity in a Layer-specific Manner.

Measurements
Soma Surface :  1222.99 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  29
Overall Width :  223.09 μm
Overall Height :  516.55 μm
Overall Depth :  44.2 μm
Average Diameter :  0.98 μm
Total Length :  2148.78 μm
Total Surface :  7205.22 μm2
Total Volume :  2172.92 μm3
Max Euclidean Distance :  434.07 μm
Max Path Distance :  549.15 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1337
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.65
Average Bifurcation Angle Local :  78.85°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.95°
Fractal Dimension :  1.04

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