8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_101613
Cell Name :  Oct28IR1b-40x-NL
Archive Name :  Luebke
Species Name :  mouse
Strain :  CD1
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 4, primary somatosensory
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  non-Tbr2 lineage
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, Streptavidin-Alexa 405
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-07-27
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  Oct28IR1b-40x-NL.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Distinct Neocortical Progenitor Lineages Fine-tune Neuronal Diversity in a Layer-specific Manner.

Measurements
Soma Surface :  841.11 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  50
Overall Width :  251.87 μm
Overall Height :  555.85 μm
Overall Depth :  55.49 μm
Average Diameter :  0.74 μm
Total Length :  3962.6 μm
Total Surface :  10239.7 μm2
Total Volume :  2390.62 μm3
Max Euclidean Distance :  555.75 μm
Max Path Distance :  566.17 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  5168
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  1.8
Average Bifurcation Angle Local :  60.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.95°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website