8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108569
Cell Name :  NeuronStudio_VehicleControl_48hpf2
Archive Name :  Morrice
Species Name :  zebrafish
Strain :  mnx1-GFP
Structural Domains :  No Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 days
Max Age :  2.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  spinal cord
Secondary Brain Region :  ventral
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Motoneuron
Tertiary Cell Class :  Caudal primary
Original Format :  NeuronStudio.nst
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  36  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2018-11-02
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  NeuronStudio_VehicleControl_48hpf2.pvec
Note :  Reconstruction from the XZ axis (cross sectional) of somite region 6-9. See "Morphology File (Original)" link above for orientation relative to the spinal cord.

Reference Article
Related Article Reference :  Modeling Environmentally-Induced Motor Neuron Degeneration in Zebrafish.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  56
Overall Width :  183.17 μm
Overall Height :  626.9 μm
Overall Depth :  75.25 μm
Average Diameter :  6.7 μm
Total Length :  2261.95 μm
Total Surface :  52577.8 μm2
Total Volume :  125461 μm3
Max Euclidean Distance :  480.96 μm
Max Path Distance :  744.03 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  254
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  1.57
Average Bifurcation Angle Local :  115.83°
Average Bifurcation Angle Remote :  108°
Fractal Dimension :  1.03

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