8.6.92 - Released: 2025-10-03 - Content: 280015 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_302935
Cell Name :  NG14-3PIO_4DIV-NPC2-GFP-PDE-filipin-LAMP-1a
Archive Name :  Soto
Species Name :  mouse
Strain :  Npc1nmf164-Pcp2EGF;B6;FVB-Tg(Pcp2-EGFP)2Yuza/J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  10.0 days
Max Age :  10.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Purkinje
Tertiary Cell Class :  LAMP1-positive, pyruvate dehydrogenase-E1 alpha (PDE)-positive, Filipin-positive, NPC2
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  NPC1 mutant
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2024-05-14
Date of Upload :  2025-09-25
Persistence Vector :  NG14-3PIO_4DIV-NPC2-GFP-PDE-filipin-LAMP-1a.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Trehalose enhances mitochondria deficits in human NPC1 mutant fibroblasts but disrupts mouse Purkinje cell dendritic growth ex vivo.

Measurements
Soma Surface :  169.51 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  41
Overall Width :  16.91 μm
Overall Height :  84.74 μm
Overall Depth :  3.63 μm
Average Diameter :  1.76 μm
Total Length :  272.27 μm
Total Surface :  1486.04 μm2
Total Volume :  789.92 μm3
Max Euclidean Distance :  90.62 μm
Max Path Distance :  109.38 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  926
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  2.08
Average Bifurcation Angle Local :  30.79°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.49°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website