8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_110352
Cell Name :  N049
Archive Name :  Luo
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP-M
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  60.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  20.5 grams
Max Weight :  20.5 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 5-6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  corticofugal
Original Format :  Amira.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2019-02-23
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  N049.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Single-axon level morphological analysis of corticofugal projection neurons in mouse barrel field.

Measurements
Soma Surface :  1.17 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  63
Number of Branches :  132
Overall Width :  2728.04 μm
Overall Height :  2663.38 μm
Overall Depth :  1747.72 μm
Average Diameter :  1.05 μm
Total Length :  16219.3 μm
Total Surface :  51286.6 μm2
Total Volume :  28625.3 μm3
Max Euclidean Distance :  3072.83 μm
Max Path Distance :  7236.36 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  4505
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  12.64
Average Bifurcation Angle Local :  63.92°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.44°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website