8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_110357
Cell Name :  N008
Archive Name :  Luo
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP-M
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  120.0 days
Max Age :  120.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  28.1 grams
Max Weight :  28.1 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 5-6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  corticofugal
Original Format :  Amira.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  2  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2019-02-23
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  N008.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Single-axon level morphological analysis of corticofugal projection neurons in mouse barrel field.

Measurements
Soma Surface :  1.16 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  44
Overall Width :  1134.45 μm
Overall Height :  982.63 μm
Overall Depth :  1845.47 μm
Average Diameter :  1.15 μm
Total Length :  6902.68 μm
Total Surface :  25565.8 μm2
Total Volume :  15946.7 μm3
Max Euclidean Distance :  2056.43 μm
Max Path Distance :  3867.16 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  2345
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  18.39
Average Bifurcation Angle Local :  89.18°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.95°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website