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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07618
Cell Name :  N-6-1-3-3-L
Archive Name :  Lee
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/TrkB.T1 deficient
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  29 grams
Max Weight :  36 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2011-10-21
Date of Upload :  2012-05-17
Persistence Vector :  N-6-1-3-3-L.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Endogenous truncated TrkB.T1 receptor regulates neuronal complexity and TrkB kinase receptor function in vivo

Measurements
Soma Surface :  1091.98 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  29
Number of Branches :  62
Overall Width :  394.25 μm
Overall Height :  497.57 μm
Overall Depth :  98.77 μm
Average Diameter :  1.44 μm
Total Length :  5872.42 μm
Total Surface :  26384.2 μm2
Total Volume :  10004.1 μm3
Max Euclidean Distance :  372.24 μm
Max Path Distance :  483.55 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1177
Partition Asymmetry :  0.25
Average Rall's Ratio :  1.44
Average Bifurcation Angle Local :  85.18°
Average Bifurcation Angle Remote :  48.58°
Fractal Dimension :  1.02

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