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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07612
Cell Name :  N-3-1-3-1-R
Archive Name :  Lee
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/TrkB.T1 deficient
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  29 grams
Max Weight :  36 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2011-10-21
Date of Upload :  2012-05-17
Persistence Vector :  N-3-1-3-1-R.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Endogenous truncated TrkB.T1 receptor regulates neuronal complexity and TrkB kinase receptor function in vivo

Measurements
Soma Surface :  1165.86 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  45
Overall Width :  222.1 μm
Overall Height :  342.51 μm
Overall Depth :  96.28 μm
Average Diameter :  1.29 μm
Total Length :  3473.62 μm
Total Surface :  14435.8 μm2
Total Volume :  5072.62 μm3
Max Euclidean Distance :  279.02 μm
Max Path Distance :  328.88 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  865
Partition Asymmetry :  0.29
Average Rall's Ratio :  1.43
Average Bifurcation Angle Local :  73.05°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.84°
Fractal Dimension :  1.03

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