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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_290802
Cell Name :  Mouse-L2_3-V2-5
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  56.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  secondary visual, layer 2-3
Primary Cell Class :  Unknown
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  600  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2023-03-22
Date of Upload :  2024-11-25
Persistence Vector :  Mouse-L2_3-V2-5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Connectomic comparison of mouse and human cortex.

Measurements
Soma Surface :  4871100 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  6
Overall Width :  119.6 μm
Overall Height :  2419.99 μm
Overall Depth :  836.26 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  3934.97 μm
Total Surface :  12362.1 μm2
Total Volume :  3090.52 μm3
Max Euclidean Distance :  2607.08 μm
Max Path Distance :  2671.27 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.98
Total Fragmentation :  31
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  32.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  4.2°
Fractal Dimension :  1

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