8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_290645
Cell Name :  Mouse-L2_3-A2-34
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  56.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  parietal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3, secondary auditory
Primary Cell Class :  Unknown
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2023-03-22
Date of Upload :  2024-11-25
Persistence Vector :  Mouse-L2_3-A2-34.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Connectomic comparison of mouse and human cortex.

Measurements
Soma Surface :  13748800 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  8
Overall Width :  882.08 μm
Overall Height :  15130.1 μm
Overall Depth :  2440.71 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  21171.7 μm
Total Surface :  66512.7 μm2
Total Volume :  16628.2 μm3
Max Euclidean Distance :  8918.94 μm
Max Path Distance :  9072.08 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  132
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  43.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  39.35°
Fractal Dimension :  1

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website