8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_290571
Cell Name :  Mouse-L1-5-PPC-2-1
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  56.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  parietal
Tertiary Brain Region :  posterior association area, Area 2, Layer 1-5
Primary Cell Class :  Unknown
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  600  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2023-03-22
Date of Upload :  2024-11-25
Persistence Vector :  Mouse-L1-5-PPC-2-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Connectomic comparison of mouse and human cortex.

Measurements
Soma Surface :  8590240 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  96
Overall Width :  1705.69 μm
Overall Height :  31481.9 μm
Overall Depth :  16412.5 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  124403 μm
Total Surface :  781648 μm2
Total Volume :  390824 μm3
Max Euclidean Distance :  19339.6 μm
Max Path Distance :  22569.2 μm
Max Branch Order :  35
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1494
Partition Asymmetry :  0.84
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  91.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.72°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website