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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_139016
Cell Name :  Molofsky_20
Archive Name :  Molofsky
Species Name :  mouse
Strain :  Il1rl1flox/flox
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Genetic deletion of Il1rl1
Staining Method :  AAV + eGFP
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2020-08-04
Date of Upload :  2020-08-21
Persistence Vector :  Molofsky_20.pvec
Note :  Reconstruction was obtained from an Il1rl1 line encoding a co-receptor of IL-33.

Reference Article
Related Article Reference :  Microglial Remodeling of the Extracellular Matrix Promotes Synapse Plasticity.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  28
Overall Width :  188.58 μm
Overall Height :  104.08 μm
Overall Depth :  12.02 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  930.02 μm
Total Surface :  730.44 μm2
Total Volume :  45.65 μm3
Max Euclidean Distance :  181.12 μm
Max Path Distance :  216.89 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  4801
Partition Asymmetry :  0.7
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  61.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  44.81°
Fractal Dimension :  1.06

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