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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_139428
Cell Name :  McCauley_et_al2020
Archive Name :  Scimemi
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  7 grams
Max Weight :  8 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  CA1b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic
Original Format :  Simple Neurite Tracer.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, streptavidin-488
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2020-09-01
Date of Upload :  2020-09-10
Persistence Vector :  McCauley_et_al2020.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Circadian modulation of neurons and astrocytes controls synaptic plasticity in hippocampal area CA1

Measurements
Soma Surface :  711.74 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  69
Number of Branches :  142
Overall Width :  902.73 μm
Overall Height :  583.54 μm
Overall Depth :  72.51 μm
Average Diameter :  2.79 μm
Total Length :  8124.5 μm
Total Surface :  71367.1 μm2
Total Volume :  50761 μm3
Max Euclidean Distance :  853.99 μm
Max Path Distance :  971.94 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  6906
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  82.33°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.12°
Fractal Dimension :  1.02

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