8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_143142
Cell Name :  MS_p21c2
Archive Name :  Studer
Species Name :  mouse
Strain :  Nr2f1 fl/fl; Emx1-Cre
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Nr2f1 conditional knock-out
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-09-07
Date of Upload :  2020-11-03
Persistence Vector :  MS_p21c2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  COUP-TFI/Nr2f1 Orchestrates Intrinsic Neuronal Activity during Development of the Somatosensory Cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  34
Overall Width :  86.7 μm
Overall Height :  127 μm
Overall Depth :  20.45 μm
Average Diameter :  1.74 μm
Total Length :  821.72 μm
Total Surface :  4399.77 μm2
Total Volume :  2266.31 μm3
Max Euclidean Distance :  85.81 μm
Max Path Distance :  93.39 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  552
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.89
Average Bifurcation Angle Local :  45.48°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.8°
Fractal Dimension :  1.01

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