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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_143116
Cell Name :  MS_p18c3
Archive Name :  Studer
Species Name :  mouse
Strain :  Nr2f1 fl/fl; Emx1-Cre
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Nr2f1 conditional knock-out
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-09-07
Date of Upload :  2020-11-03
Persistence Vector :  MS_p18c3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  COUP-TFI/Nr2f1 Orchestrates Intrinsic Neuronal Activity during Development of the Somatosensory Cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  40
Overall Width :  69.44 μm
Overall Height :  542.45 μm
Overall Depth :  40.08 μm
Average Diameter :  2.18 μm
Total Length :  1278.81 μm
Total Surface :  8614.42 μm2
Total Volume :  5610.55 μm3
Max Euclidean Distance :  417.65 μm
Max Path Distance :  457.18 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  870
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  1.8
Average Bifurcation Angle Local :  49.23°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.47°
Fractal Dimension :  1.01

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