8.6.74 - Released: 2025-03-12 - Content: 273509 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_143145
Cell Name :  MS_p17c5
Archive Name :  Studer
Species Name :  mouse
Strain :  Nr2f1 fl/fl; Emx1-Cre
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  8.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Nr2f1 conditional knock-out
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-09-07
Date of Upload :  2020-11-03
Persistence Vector :  MS_p17c5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  COUP-TFI/Nr2f1 Orchestrates Intrinsic Neuronal Activity during Development of the Somatosensory Cortex.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  30
Overall Width :  66.59 μm
Overall Height :  282.87 μm
Overall Depth :  17.52 μm
Average Diameter :  1.77 μm
Total Length :  605.33 μm
Total Surface :  3201.66 μm2
Total Volume :  1683.69 μm3
Max Euclidean Distance :  239.38 μm
Max Path Distance :  247.93 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  404
Partition Asymmetry :  0.7
Average Rall's Ratio :  1.95
Average Bifurcation Angle Local :  48.98°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.85°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website