8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_283250
Cell Name :  MSN_Cell_4
Archive Name :  Nair_Augustine
Species Name :  mouse
Strain :  ChR2-YFP; TH-Cre; Ai32
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  42.0 days
Max Age :  98.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  dorsal nucleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  tyrosine-hydroxylase-positive
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2020-01-11
Date of Upload :  2024-06-13
Persistence Vector :  MSN_Cell_4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A Novel Type of Neuron Within the Dorsal Striatum.

Measurements
Soma Surface :  1275.43 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  30
Number of Branches :  70
Overall Width :  197.62 μm
Overall Height :  299.36 μm
Overall Depth :  26.21 μm
Average Diameter :  0.8 μm
Total Length :  3220.16 μm
Total Surface :  8074.34 μm2
Total Volume :  1958.91 μm3
Max Euclidean Distance :  192.99 μm
Max Path Distance :  202.29 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1364
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2.54
Average Bifurcation Angle Local :  53.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.18°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website