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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66580
Cell Name :  MMP9KO-P7-11
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  7.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-P7-11.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  38339.1 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  17
Overall Width :  58.81 μm
Overall Height :  283.66 μm
Overall Depth :  1 μm
Average Diameter :  4.12 μm
Total Length :  769.01 μm
Total Surface :  10118.9 μm2
Total Volume :  11607.2 μm3
Max Euclidean Distance :  197.79 μm
Max Path Distance :  247.25 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  96
Partition Asymmetry :  0.71
Average Rall's Ratio :  1.54
Average Bifurcation Angle Local :  54.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.42°
Fractal Dimension :  1.05

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