8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66571
Cell Name :  MMP9KO-P4-2
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 days
Max Age :  4.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-P4-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  56961.7 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  12
Overall Width :  47.93 μm
Overall Height :  297.15 μm
Overall Depth :  18.59 μm
Average Diameter :  3.47 μm
Total Length :  545.7 μm
Total Surface :  6041.37 μm2
Total Volume :  5579.73 μm3
Max Euclidean Distance :  253.23 μm
Max Path Distance :  283.74 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  58
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.65
Average Bifurcation Angle Local :  57.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.03°
Fractal Dimension :  1.03

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