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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66615
Cell Name :  MMP9KO-P14-8
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  14.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-P14-8.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  7013.74 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  45
Overall Width :  159.7 μm
Overall Height :  175.22 μm
Overall Depth :  12.96 μm
Average Diameter :  0.59 μm
Total Length :  1225.29 μm
Total Surface :  2385.73 μm2
Total Volume :  459.73 μm3
Max Euclidean Distance :  153.85 μm
Max Path Distance :  184.02 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  760
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.76
Average Bifurcation Angle Local :  43.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.77°
Fractal Dimension :  1.03

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