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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66645
Cell Name :  MMP9KO-2V1-LayerIII-8
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-2V1-LayerIII-8.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  21888.1 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  25
Overall Width :  85.56 μm
Overall Height :  291.44 μm
Overall Depth :  37.46 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  1179.19 μm
Total Surface :  3754.9 μm2
Total Volume :  1271.55 μm3
Max Euclidean Distance :  265.02 μm
Max Path Distance :  315.73 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  513
Partition Asymmetry :  0.17
Average Rall's Ratio :  1.55
Average Bifurcation Angle Local :  86.4°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.88°
Fractal Dimension :  1.04

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