8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66627
Cell Name :  MMP9KO-2HP-13
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-2HP-13.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  17655.1 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  23
Overall Width :  150.01 μm
Overall Height :  261.49 μm
Overall Depth :  37.55 μm
Average Diameter :  1.13 μm
Total Length :  1470.77 μm
Total Surface :  5497.99 μm2
Total Volume :  1924.61 μm3
Max Euclidean Distance :  192.7 μm
Max Path Distance :  265.22 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  675
Partition Asymmetry :  0.38
Average Rall's Ratio :  1.51
Average Bifurcation Angle Local :  110.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  34.66°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website