8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66624
Cell Name :  MMP9KO-2HP-10
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-2HP-10.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  11091.5 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  36
Overall Width :  171.14 μm
Overall Height :  294.66 μm
Overall Depth :  31.18 μm
Average Diameter :  1.11 μm
Total Length :  1901.44 μm
Total Surface :  6576.23 μm2
Total Volume :  1895.67 μm3
Max Euclidean Distance :  215.38 μm
Max Path Distance :  264.45 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  840
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.79
Average Bifurcation Angle Local :  84.9°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.77°
Fractal Dimension :  1.03

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