8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66638
Cell Name :  MMP9KO-1V1-LayerIII-7
Archive Name :  Murase
Species Name :  mouse
Strain :  MMP-9 -/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-26
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  MMP9KO-1V1-LayerIII-7.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Matrix Metalloproteinase-9 Regulates Neuronal Circuit Development and Excitability.

Measurements
Soma Surface :  16620.5 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  32
Overall Width :  130.49 μm
Overall Height :  230.94 μm
Overall Depth :  30.42 μm
Average Diameter :  1.1 μm
Total Length :  1362.67 μm
Total Surface :  4902.99 μm2
Total Volume :  1537.69 μm3
Max Euclidean Distance :  174.67 μm
Max Path Distance :  193.01 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  644
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.59
Average Bifurcation Angle Local :  94.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.24°
Fractal Dimension :  1.03

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